L’ANMAPS est une Autorité Administrative Indépendante sous la tutelle du ministère en charge de la santé, qui dispose de l’autonomie de gestion. Son siège est à Libreville. Les personnels de l’ANMAPS sont soumis qu’à la loi et à l’éthique lorsqu’ils disent le règlement et la norme en matière de médicament et des produits de santé à usage humain et à usage vétérinaire ainsi que des médicaments traditionnels améliorés.